Pain es un personaje del manga y anime Naruto. Pain es el reconocido líder de la Organización Akatsuki y proviene de la Aldea Oculta de la Lluvia. Él es referido como "líder" por todos los miembros a excepción de Konan, quien le llama por su nombre. Aunque él dirige las acciones de los demás miembros e impone autoridad sobre ellos, Pain recibe ordenes de Tobi,quien dice ser en realidad Madara Uchiha. Además de actuar como el líder de Akatsuki, Pain fue el líder del bando triunfador en la guerra más reciente en el País de la Lluvia.
 

Inicialmente, sólo se e Naruto Uzumaki y unos ojos con varios círculos concéntricos de distintos tonos de gris. Aparece en muestra su silueta durante la extracción de los Bijūs, con un peinado de múltiples picos similar al dpersona por primera vez muy brevemente, revelando los objetivos finales de Akatsuki. Más tarde se le ve sobre una estatua en una gran ciudad, donde los edificios, aunque similares en aspecto a los de Konoha, son mucho más altos, y están cubiertos de tubos y cables. Esta ciudad resulta ser la Aldea Oculta de la Lluvia. Posee el cabello color naranja. Es el único que ha dado órdenes a los otros miembros y ninguno se ha opuesto o le ha desafiado, salvo quizá Hidan, que incluso le insultó.

En el capítulo 363 en el manga y en capítulo 125 en el anime aparece al descubierto, mostrando múltiples piercings en los labios, la nariz y las orejas. En ese momento se le muestra junto a Konan, su compañera y amiga de toda la vida, aunque tambien aparece al descubierto en el capítulo 114 de Naruto Shippuden en un recuerdo de Orochimaru cuando anuncia a un nuevo integrante de Akatsuki que resulta ser Itachi Uchiha.

Pain es una persona sumamente seria, sin ningún grado de humor. Pain posee un dojutsu transmitido por el dios de los 6 caminos Rikudou, este dojutsu es llamado Rin'negan (Ojo de metempsicosis) con el cual puede dividir su alma y habilidades unicas otorgadas por éste entre sus 6 cuerpos. Se dice que el verdadero Pain no suele mostrarse ante el mundo y los comanda a escondidas. Recientemente en la historia se ha revelado el verdadero cuerpo de Pain que es el de un joven con el aspecto completamente demacrado, desnutrido y tiene el cabello rojo, con varias barras negras incrustadas en la espalda y a la altura de sus brazos que también están recubiertos por una extraña estructura y finalmente un mecanismo de cuatro patas que le permite moverse. Este joven no es otro sino Nagato.En el capítulo 510 del manga se revela que era un miembro del Clan Uzumaki.
Su personalidad es calma y fria, muy analítico con sus rivales. Al principio se le da una imagen de que solo quiere obtener el poder de los bijus para sus fines pero, aunque sea asi, el en realidad quiere que halla paz. Él cree que la unica forma de que halla paz en el mundo es haciendo que la gente comprenda el dolor, por lo que parte de su objetivo es hacerles sentir ese dolor, y ahi comprendan lo importante que es la paz. Por esto se puede deducir que el es una persona de gran corazón, muy buena aunque por diveros motivos y situaciones que vivio, eligio el camino incorrecto para realizar su objetivo
 

Pain se encuentra en la Aldea Oculta de la Lluvia junto su compañera Konan. Allí, Tobi, que se revela a sí mismo con Madara Uchiha y verdadero dirigente de Akatsuki al dar órdenes a Pain y le encomienda capturar al Kyūbi.

En Konoha, Jiraiya se presenta ante Tsunade y le explica que va a ir a la Aldea de la Lluvia ya que se enteró que Pain se encotraba en dicha Aldea. Antes de marchar, los dos tienen una conversación en la que se revela que los padres de Naruto son Minato Namikaze, Cuarto Hokage y Kushina Uzumaki. Después de recordar esto junto a Tsunade, Jiraiya se marcha, y tras infiltrarse con éxito en la Aldea de la Lluvia, Jiraiya captura a dos ninjas de bajo rango, de los que consigue sacar cierta información, referente a la subida al poder de Pain tras haber derrotado al anterior líder, Salamandra Hanzō.

Jiraiya va en busca de Pain, pero Konan se da cuenta de su presencia y lo intercepta, lo cual trae al sannin recuerdos de cómo conoció a ésta y a sus dos compañeros, Nagato y Yahiko cuando eran niños, y los entrenó. Entonces, Pain aparece ante él con el 2 cuerpo. Éste empieza a invocar distintos animales gigantes, contra los que Jiraiya debe luchar. Durante esta pelea, Pain revela que quiere capturar a todos los Bijūs para crear una nueva técnica que le permitirá destruir países enteros. Jiraiya invoca a dos ancianos sapos que le permiten realizar una técnica mediante la cual entra en modo ermitaño, que le otorga mayor poder, además de poder realizar el Chō Odama Rasengan. Uno de los cuerpos en que se manifiesta Pain absorbe el Rasengan, por lo que tiene que retirarse a pensar una nueva estrategia, puesto que los tres cuerpos que están actuando a la vez, permiten que Pain no tenga punto ciego.

Jiraiya decide utilizar un poderoso genjutsu que realizan los dos sapos croando. Éste funciona, y el sannin parece haber ganado, pero aparecen tres cuerpos más de Pain, que revela que en realidad son seis, decantando la batalla en su propio favor. Pain revela que todos ellos son Pain, y Jiraiya reconoce en todos ellos, ninjas que ya ha visto antes, entre ellos a Yahiko.

Jiraiya, que queda malherido tras el ataque de Pain, empieza a recordar fragmentos de su vida y acaba pensando en minato y su esposa, en cómo estos decidieron llamar Naruto a su hijo debido al heroico protagonista de una de sus novelas. A la vez, comprende la verdadera naturaleza de Pain, que anota en un mensaje cifrado en uno de los dos sapos, el cual marcha hacia Tsunade. Jiraiya es finalmente derrotado y lanzado al agua donde con su último aliento piensa que su siguiente libro se llamará La historia de Naruto Uzumaki.
 

Se puede ver a Pain, junto con Konan y sus otros cuerpos derrotando a un grupo de ninjas y llegando por fin a Konoha. Pain y Konan empiezan la destrucción de la Aldea y la captura del Kyubi. Sus cuerpos se dividen en 2 escuadrones, uno de reconocimiento donde esta Konan y otro de distracción. Una vez dentro de Konoha encuentra a Iruka, e intenta sacarle información sobre el Kyūbi, Iruka se niega a responder y Pain decide matarlo, en ese momento aparece Kakashi Hatake, quien lo detiene. Iruka escapa y empieza una pelea entre Kakashi y Pain. Pain (Yahiko), sigue luchando contra Kakashi y los demás cuerpos siguen con sus planes. En la lucha con el Jounin, convoca el quinto cuerpo. El cuerpo de Yahiko y el quinto cuerpo, siguen luchando con el Hatake, hasta llegar a un límite en el que el joven Jonin esta a punto de ser derrotado, hasta que aparece Chouza y Chōji Akimichi que aplastan al Quinto cuerpo.Los Akimichi y Kakashi siguen luchando contra Pain, pero todos sus ataques son evadidos. Kakashi confirma que Pain tiene el poder de atraer o repeler cuerpos, así como manejarlos a placer. Después hay una pausa en la que se da paso a un cambio de escena en la que se ve a Naruto preocupado por Konoha. Cuando la escena vuelve a la pelea, se ven a los Akimichi y a Kakashi derrotados, este último sin banda y bajo un montón de escombros. Pain decide darle el golpe de gracia a Kakashi, sin embargo, no se quiere acercar por precaución, así que coge un clavo que hay en el suelo y se lo lanza a Kakashi, manejándolo con su poder. No se ve explícitamente, pero la última viñeta, en la que se ve la silueta de Kakashi, sugiere que el clavo ha herido a Kakashi, probablemente en la frente o en un ojo. Luego, Pain ve al quinto cuerpo moribundo y se retira, creyendo haber matado a los Akimichi y a Kakashi. Luego de lamentar la muerte de Choza, Kakashi le ordena a Choji que hable con Tsunade, sin embargo el quinto cuerpo no estaba muerto y le dispara un misil y el Hatake lo desvía con su Sharingan, muriendo el quinto cuerpo. Más tarde, el reino de los infiernos interroga a dos chunin de Konoha y estos se niegan a responderle muriendo a manos de Pain. Esto es visto por Konahamaru y decide escapar, sin embargo Pain lo nota y esta dispuesto a seguirlo. En ese instante aparece Ebisu y Pain lo interroga, produciendo que el Jonin recuerde sus momentos con Naruto y negándose a responderle al Akatsuki. Pain ahorca a Ebisu pero Konahamaru le arroja unos kunais liberando a su sensei. Mientras tanto Ino y los demás se dirigen al departamento de descriptación, e Ibiki retiene al reino de los animales. Naruto y Fukasaku intentan nuevamente la fusión, pero el Kyubi rechaza al sapo, y el Uzumaki le explica que el código esta dirigido exclusivamente a él, diciendo que nunca se rinda. Luego, el Pain de los infiernos sigue luchando con el pequeño Sarutobi, y este ejecuta el rasengan atacando al 6 cuerpo. Mientras tanto Pain (Yahiko) le explica a Tsunade sus planes y le pregunta la ubicación de Naruto, y la Godaime se rehúsa a contestar, y le advierte que no la subestime a ella ni a Naruto. Más tarde Pain (reino de los humanos) ataca a Shizune y descubre la ubicación de Naruto avisando a Pain (Yahiko). Más tarde Pain (Yahiko) reflexiona sobre la ubicación de Naruto, y observa que Tsunade ya sabe su habilidades y le advierte el dolor que sufrirá el mundo. Luego todos los cuerpos se unen excepto el de Yahiko, y le dicen a Konan que realizarán el Shinra Tensei, devastando Konoha. En ese instante, Naruto, Shima, Fukasaku, Gamabunta, Gamaken y Gama, son invocados en Konoha, y Pain Yahiko le dice que le ahorro mucho tiempo de buscarlo. Más tarde los demás cuerpos son reactivados y Pain del reino del infierno llama a su invocación y se traga al Pain del camino de los demonios y así, se recupera de todos los daños que había sufrido. Konan le dice que tenga más cuidado, y reflexiona sobre el altísimo riesgo que corre al utilizar el Shinra Tensei. En ese instante el Pain del reino de los animales, convoca a los demás cuerpos en el lugar de la batalla. Tsunade, se dispone a luchar exausta por haber usado el Ninpou: Souzou Sazei, y el Pain del reino de los demonios la ataca pero Naruto interviene derrotando al cuerpo fácilmente. Más tarde el reino de los animales invoca un rinoceronte, pero Naruto lo derrota. Al mismo instante convoca a un perro y a un toro, pero Fukasaku y Shima lo atrapan en un genjutsu y Naruto los derrota con un Odama rasengan. Luego, el Pain de los fantasmas hambrientos se dispone a absorber un ninjutsu de Naruto, pero Katsuyu le dice que las técnicas ninjas no sirven, entonces Naruto ataca a Pain con Taijutsu Sennin y lo deja moribundo. En ese instante, Naruto realiza el Fuuton: Rasen Shuriken y se entera que Jiraiya fue maestro de Pain. Al mismo tiempo lanza el Rasen Shuriken y mata al cuerpo de los humanos. Más tarde, Shima realiza un jutsu de humo sobre los cuerpos y Naruto ejecuta un Odama Rasengan dejando inconsciente al reino de los animales.Más tarde, todos los demás cuerpos son derrotados por Naruto, exepto Pain Yahiko y Pain de los fantasmas hambrientos. Pain realiza su manipulación de la gravedad para atraer a Naruto, y Pain de los fantasmas hambrientos lo agarra y lo debilita, sacándole todo su senjutsu y chakra interna. Al ver esto, Pain Yahiko afirma que la misión fue un éxito y que el Kyubi había sido capturado. En ese momento, Naruto utiliza uno de los clones que había dejado reuniendo chakra natural en Myobokuzan; de esta manera Pain de los fantasmas hambrientos continúa absorbiendo chakra natural a tal punto que no puede controlarlo y sufre la Petrificación del Sapo. Luego, Naruto desafía a Pain Yahiko, pero éste utiliza su técnica de atracción sobre Fukasaku, atacándolo con la espada que utilizó en la batalla contra Jiraiya. Naruto, reacciona a esto y Pain, utiliza nuevamente su técnica de atracción tirándolo al suelo a Naruto y clavándole la misma espada en sus manos y mostrando el poder del Rinnegan.Luego continúa hablando con Naruto sobre la paz y el objetivo de capturar a los bijus. Mientras tanto Konan, recrimina a Nagato por el uso excesivo de chakra, ya que este degradó su vida aún más por utilizar el Shinra Tensei en sucesivas oportunidades. Luego, Pain inserta mas estacas al cuerpo de Naruto inmovilizándolo. En ese momento, Hinata aparece y se interpone entre Pain y Naruto, disponiéndose así pelear contra Pain. Aunque Naruto le pide que huya pues sino moriría, ella le responde que está dispuesta a morir por el debido a que lo ama. Pain la vence fácilmente con un Shinra tensei y luego le clava una estaca negra, enfureciendo así a Naruto que libera 6 colas del Kyubi

Pain Yahiko comienza a pelear con Naruto-Kyubi y lo ataca con el Shinra Tensei, pero Naruto la resiste y se la devuelve, contraatacándolo con una bola de chakra pero Pain Yahiko usa el Bansho Tenin y lo golpea con una roca antes de que lance su ataque, lo cual causa una gran explosión que envuelve a ambos. Al ver este resultado Pain decide llevar a Naruto cerca de Pain Nagato, una vez mas próximo a este, usa su técnica "Chibaku Tensei". encerrando a Naruto en una bola de tierra. Este último ataque provoca que Nagato se fatigue más, y aún con esto él cree haber atrapado al Kyubi, pero al liberarse la octava cola, Pain Yahiko lo mira impresionado. Justo antes de liberar la novena cola por la influencia del Kyubi, naruto esta a punto de romper el sello, pero en ese instante Minato (Cuarto Hokage)lo detiene a tiempo y confiesa ser su padre, que el ataque del Kyubi hace 16 años fue provocado por Madara(Tobi, que él ahora es el Akatsuki que tiene la máscara (Tobi) y que Pain es manipulado por él. Luego Yondaime realiza de nuevo el sello y vuelve a encerrar al Kyubi dentro de Naruto. De esta manera las colas desaparecen y vuelve al modo sennin para comenzar de nuevo la pelea contra Pain Yahiko. Naruto dice que va a localizar a Nagato por su cuenta y rompe una de las estacas de Pain Yahiko y se la clava, de esa manera logra saber la localización de Nagato. Luego, Naruto lanza dos rasen shuriken hacia Pain Yahiko pero el evita el primero con su "shinra tensei" pero el segundo estaba escondido en la sombra del anterior dejando a Pain muy sorprendido. Después dos clones de Naruto lo intentan atrapar para que no escape pero Pain los clava con sus estacas negras, muchos clones de Naruto se habían camuflado como piedras, entonces Pain usa el shinra tensei pero tres de los clones lo soportan. En el intervalo de 5 segundos Naruto hace un rasengan y es lanzado por un clon, impactando con este ataque a Deva directamente. Al Final Pain Yahiko queda tirado en el suelo, muerto, y Naruto le saca sus estacas para que éste no se mueva más... Después de esto, Naruto se dispone a localizar a Nagato, pero en el camino se encuentra con Shikaku, Inoichi y un Hyūga. Inoichi trata de detener a Naruto diciéndole que es una locura de ir a buscar al verdadero Pain el solo pero Naruto, dispuesto a la búsqueda de Nagato, le dice que cual es la manera de hacer las cosas "¿matándolo y destruyendo a todos sus camaradas?"... Al final Shikaku le dice a Inoichi que lo deje ir, Naruto, continuando su camino, logra llegar hasta a un gran árbol hecho de origami, donde se encuentra Nagato y Konan.